La disputa que lleva un par de años entre las comunas que cuentan con Sistema Educativo Municipal (SEM) y la Provincia, por la forma en que se reparte el Fondo Federal Educativo (FFE), debería estar resuelto. Es que el Presupuesto 2017 de la Nación especifica en su artículo Nº 19 que se deberá producir la "coparticipación automática de los recursos a los municipios” para cubrir gastos estrictamente ligados a la finalidad y función educación, a los fines de dar cumplimiento con los "objetivos de la política educativa nacional”.
En abril de 2016 la Municipalidad de la Capital reclamó al Gobierno provincial una deuda de $134 millones por partidas que habrían dejado de percibir luego de que el Ministerio de Educación de Catamarca comenzara a aplicar un método distinto de reparto de los fondos.
La comuna capitalina había denunciado que Educación modificó "arbitrariamente” el criterio de distribución del Fondo Federal Educativo, algo que se produjo en detrimento de los Sistemas Educativos Municipales, no solo de Capital, sino también de Valle Viejo y Fray Mamerto Esquiú.
Con esa nueva interpretación de Educación, entendían que los fondos debían repartirse según la matrícula municipal de cada comuna.
De hecho, se denunció que incrementó automáticamente el coeficiente provincial de imputación para distribución del FFE de 94,47% a 95,50%; mientras que disminuyó el coeficiente de distribución para la Capital de 2,26% a 1,70% y que la misma situación se reflejó en el resto de los municipios que tienen sistema educativo propio.
En reiteradas oportunidades funcionarios de la comuna capitalina sostuvieron que los recursos del FFE deberían llegar desde la Nación al Municipio, sin que Educación ni Hacienda ejerzan ningún tipo de retención.